Upravni odbor Hrvatske zaklade za znanost na svojoj je 97. sjednici donio odluku (Klasa: 120-02/24-02/24, URBROJ: 410-03-01-24-5) o neprihvatljivosti internih računa na projektima Zaklade. Ovom odlukom poništena je odluka Upravnog odbora od 15. lipnja 2022. godine (Klasa: 120-02/22-02/12, Ur. broj: 63-02/01-22-13) kojom su interni računi bili prihvatljivi za određene usluge.

Člankom 78. Zakona o Porezu na dodanu vrijednost je propisano kako je svaki porezni obveznik obvezan izdati račun za isporuke dobara i usluga koje je obavio drugom poreznom obvezniku ili pravnoj osobi koja nije porezni obveznik. Također, u poglavlju XIII., čl. 157. st. 3. Pravilnika o porezu na dodanu vrijednost stoji „ako porezni obveznik izdaje interne račune za isporuke između poslovnih cjelina ili poslovnih jedinica istog poreznog obveznika, takvi računi se ne smatraju računima u smislu Zakona i ne utječu na oporezivanje, što znači da ne utječu na utvrđivanje obveze obračuna PDV-a i odbitak pretporeza”.

Stoga je Upravni odbor Zaklade donio odluku da interni računi za usluge izvršene unutar iste organizacije nisu prihvatljiva dokumentacija za troškove na projektima Hrvatske zaklade za znanost.