Rezistencija bakterija na antibiotike predstavlja jedan od vodećih problema medicine u 21. stoljeću. Dosadašnja SU istraživanja pokazala da otpadne vode farmaceutskih industrija mogu sadržavati visoke koncentracije antibiotika i kao takve predstavljaju jedan od najvažnijih izvora zagađenja okoliša antibioticima. Stoga je cilj ovog doktorskog rada razjasniti učinke ispuštanja antibiotika putem otpadnih voda dviju farmaceutskih industrija u okolici grada Zagreba na prirodne bakterijske zajednice u recipijentnim vodenim tijelima. Pritom se poseban naglasak stavlja na to kako antibiotici utječu na razvoj i širenje bakterijske rezistencije na antibiotike te na promjene u sastavu i strukturi bakterijskih zajednica u slatkovodnim sedimentima. Istraživanja u sklopu ovog doktorskog rada provedena su kroz četiri faze koje su uključivale: i) procjenu kemijskog zagađenja industrijskih otpadnih voda i recipijentnih voda primjenom visoko selektivnih analitičkih metoda; ii) identifikaciju gena odgovornih za rezistenciju na odabrane antibiotike primjenom inovativnog pristupa funkcionalne metagenomike; iii) procjenu širenja antibiotičke rezistencije u recipijentim vodama primjenom suvremenih molekularnih metoda kao što su kvantitativni PCR i egzogena izolacija plazmida; iv) procjenu biološke raznolikosti bakterijskih zajednica primjenom novih metoda sekvenciranja druge generacije. Očekuje se da će rezultati dobiveni u okviru ovog doktorskog rada doprinijeti boljem razumijevanju uloge industrijskih otpadnih voda, kao značajnog izvora zagađenja okoliša antibioticima, u razvoju i širenju rezistencije bakterija na antibiotike, uključujući i patogene bakterije. Osim toga, rezultati ovog rada predstavljaju temeljni preduvjet za procjenu rizika i razvoj strategija za smanjenje onečišćenja okoliša i zaštitu zdravlja ljudi na lokalnoj i globalnoj razini.