Zbog iscrpljenosti nalazišta nafte u bliskoj budućnosti očekuje se energetska kriza kao i kriza sirovina koje se dobivaju iz fosilnih izvora. Taj se manjak može kompenzirati kemikalijama i energentima proizvedenima iz obnovljivih šećernih, škrobnih i otpadnih lignoceluloznih sirovina. Od navedenih, otpadne ligonocelulozne sirovine imaju najveći potencijal jer ne konkuriraju prehrambenim sirovinama, ali su zbog sastava i strukture izrazito zahtjevne za proizvodnju. Cilj ovog doktorskog istraživanja bio je razvoj integriranog bioprocesnog sustava za proizvodnju i izdvajanje biogoriva (etanola) iz odabrane lignocelulozne sirovine (pulpa šećerne repe) primjenom različitih bioreaktorskih sustava. Također, cilj je bio i razviti učinkovit enzimski sustav za razgradnju lignocelulozne sirovine primjenom enzima proizvedenih uz pomoć gljiva bijelog i smeđeg truljenja. Napravljena je i optimizacija enzimske hidrolize pulpe šećerne repe upotrebom komercijalnih enzimskih pripravaka i proizvedenih ekstracelularnih enzima. Sa ciljem povećanja proizvodnje etanola provedena je integracija i optimizacija bioprocesa sastavljenog od tri stupnja: hidrolize, fermentacije i direktnog izdvajanja etanola potpomognutog vakuumom. Ovakvi bioprocesi se provode pri relativno visokom udjelu suhe tvari sirovine kako bi se ostvarili visoki prinosi etanola i smanjili troškovi izdvajanja etanola. Ipak, visoki udio suhe tvari lignocelulozne sirovine ima za posljedicu povećanje utrošaka energije za miješanje. Kako bi se omogućila uspješna provedba bioprocesa proizvodje etanola i ušteda energije, primjenjen je novi tip horizontalnog rotirajućeg cijevnog bioreaktora (HRCB). Korištenjem HRCB-a te primjenom proizvedenih lignocelulolitičkih enzima zajedno sa komercijalno dostupnim enzimima razvijen je efikasan integrirani bioprocesni sustav za proizvodnju etanola iz lignoceluloznih sirovina. Rezultati proizašli iz ove disertacije moći će se koristiti pri razvoju sličnih biotehnoloških procesa u biorafinerijama. Pri tome je važno napomenuti da se tu radi o praktički novom i brzo rastućem industrijskom sektoru koji će bitno obilježiti tehnološki i gospodarski razvitak Europske Unije i Hrvatske u idućih nekoliko desetljeća.