Karcinom pločastog epitela glave i vrata (engl. Head and Neck Squamous Cell Carcinoma, HNSCC) po učestalosti je šesta najčešća zloćudna bolest širom svijeta s 5-godišnjim preživljenjem od samo 40-50%. S obzirom na prisutnost papiloma virusa čovjeka (engl. Human Papilloma Virus, HPV), HNSCC dijelimo u dvije skupine: pozitivne na HPV i HPV-negativne HNSC. Iako se ove dvije skupine etiološki razlikuju, tretman liječenja je trenutačno isti. Cilj ovog istraživanja bio je pronaći osjetljivije i specifične biljege, kako bi se terapija prilagodila određenoj skupini oboljelih te unaprijedile dijagnostičke, prognostičke i terapeutske metode. Istraživanja na epigenetičkim promjenama u tumorima kao što su metiliranje DNA te izražaj miRNA, predstavljaju adekvatan odabir takvih specifičnih bioloških biljega. Napravljena je analiza metiliranja cijelog genoma i profiliranje miRNA u svježim uzorcima tumora na homogenoj populaciji i patološki dobro definiranim karcinomima. Analizirano je metiliranje DNA u cijelom genomu (WGM), koristeći mikročipove (microarray), a podaci profiliranja metiliranosti DNA potvrđeni su metodom pirosekvenciranja. MiRNA profiliranje je provedeno tehnologijom sekvenciranja sljedeće generacije (NGS) metode, dok su podaci validirani pomoću kvantitativne reverzno-prepisane lančane reakcije polimerazom (qRT-PCR). Nadalje, provedena je temeljita analiza preživljavanja pomoću svježih i arhivskih uzoraka uklopljenih u parafin orofaringealnog tumora i tumora usne šupljine kako bi se dobila jasnija slika razvoja bolesti u Hrvatskoj i sličnim populacijama. Dobiveni rezultati detaljno su opisani u doktorskoj disertaciji i objavljeni u znanstvenim publikacijama.